Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUSC3Q13454 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms