Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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