Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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