Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms