Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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