Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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