| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.812-201 | ENST00000610788 | 101 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | PART1_1.1-201 | ENST00000611761 | 217 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.784-201 | ENST00000613803 | 101 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.787-201 | ENST00000616522 | 101 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Hammerhead_HH9.1-201 | ENST00000616606 | 77 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.780-201 | ENST00000617336 | 101 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.801-201 | ENST00000619005 | 101 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORA63-201 | ENST00000363450 | 132 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.183-201 | ENST00000363882 | 113 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-1019P-201 | ENST00000364424 | 107 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORD48-201 | ENST00000364953 | 64 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORA20B-201 | ENST00000384220 | 132 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AL355796.1-201 | ENST00000406706 | 323 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-985P-201 | ENST00000410182 | 104 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-130P-201 | ENST00000411112 | 103 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC009310.1-201 | ENST00000414414 | 451 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AL592431.2-201 | ENST00000422198 | 171 nt | TSL 3 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC003989.2-201 | ENST00000440224 | 169 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC113195.1-201 | ENST00000579952 | 141 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MIR4713-201 | ENST00000582691 | 75 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AL355297.3-201 | ENST00000604082 | 446 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC010900.2-201 | ENST00000604508 | 210 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AL161716.1-201 | ENST00000606365 | 273 nt | TSL 5 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | U6.73-201 | ENST00000619194 | 103 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MBNL3-212 | ENST00000538204 | 11294 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.101-201 | ENST00000363154 | 102 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-271P-201 | ENST00000363858 | 105 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-1199P-201 | ENST00000411249 | 104 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC110009.1-201 | ENST00000512965 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC015712.3-201 | ENST00000559380 | 164 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC092138.2-201 | ENST00000563811 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC090398.1-202 | ENST00000580403 | 457 nt | TSL 2 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC006380.1-201 | ENST00000603598 | 186 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC040896.1-201 | ENST00000613819 | 479 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC084768.2-201 | ENST00000622736 | 221 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | ZGRF1-203 | ENST00000445203 | 6529 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORA27.1-201 | ENST00000362604 | 124 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORD115-30-201 | ENST00000364117 | 82 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.446-201 | ENST00000384178 | 104 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-417P-201 | ENST00000384712 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MIR873-201 | ENST00000401120 | 77 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AL590004.1-201 | ENST00000405321 | 300 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNA5SP100-201 | ENST00000410903 | 110 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNA5SP59-201 | ENST00000410922 | 110 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC245047.4-201 | ENST00000433189 | 144 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC069257.2-201 | ENST00000441819 | 155 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RPS26P45-201 | ENST00000471748 | 340 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | LINC02276-201 | ENST00000508388 | 138 nt | TSL 3 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORA25.15-201 | ENST00000516487 | 89 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | 5S_rRNA.3-201 | ENST00000517021 | 110 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-1137P-201 | ENST00000517073 | 99 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC022254.1-201 | ENST00000567857 | 235 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | 5S_rRNA.19-201 | ENST00000612131 | 110 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AL359075.3-201 | ENST00000613288 | 217 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | 5S_rRNA.18-201 | ENST00000621941 | 110 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | U6.108-201 | ENST00000637764 | 58 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | ATP11C-202 | ENST00000361648 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | TFEC-204 | ENST00000457268 | 6309 nt | TSL 3 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORA63D-201 | ENST00000364359 | 132 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-1175P-201 | ENST00000365200 | 107 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MIR9-3-201 | ENST00000385084 | 90 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RPL23AP36-201 | ENST00000413895 | 458 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MRPS10P1-201 | ENST00000448483 | 130 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | TMEM132D-AS1-202 | ENST00000510001 | 293 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU7-99P-201 | ENST00000516271 | 62 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-764P-201 | ENST00000516396 | 105 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MIR5094-201 | ENST00000578766 | 85 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC006504.6-201 | ENST00000590142 | 199 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RAC1P9-201 | ENST00000604990 | 392 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MGAT4C-207 | ENST00000552808 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | LINC00645-203 | ENST00000557399 | 3512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.152-201 | ENST00000363578 | 100 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-112P-201 | ENST00000363599 | 104 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-450P-201 | ENST00000364654 | 107 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-1160P-201 | ENST00000384546 | 104 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.527-201 | ENST00000384573 | 102 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-296P-201 | ENST00000384608 | 107 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MIR764-201 | ENST00000390811 | 85 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC010154.1-201 | ENST00000425857 | 269 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | FAR2P3-204 | ENST00000434661 | 444 nt | TSL 2 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC005042.3-201 | ENST00000453230 | 174 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORA70.12-201 | ENST00000516084 | 153 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU1-142P-201 | ENST00000516682 | 145 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-897P-201 | ENST00000517135 | 105 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU7-128P-201 | ENST00000517247 | 62 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC009930.1-201 | ENST00000522330 | 191 nt | TSL 5 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | MIR502-201 | ENST00000606349 | 86 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | PRPSAP2-229 | ENST00000628609 | 192 nt | TSL 5 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | AC010615.1-201 | ENST00000594254 | 1764 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | PPP2R5A-205 | ENST00000537030 | 1719 nt | TSL 2 BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.13 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | Y_RNA.143-201 | ENST00000363520 | 106 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | SNORD115-46-201 | ENST00000390982 | 71 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU11-5P-201 | ENST00000391216 | 129 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNA5SP467-201 | ENST00000391274 | 118 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | HSPE1P13-201 | ENST00000451143 | 297 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PRKAA1 | Q13131 | RNU6-1143P-201 | ENST00000516125 | 104 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |