Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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IFT88Q13099 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IFT88Q13099 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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