Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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GPS1Q13098 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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GPS1Q13098 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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GPS1Q13098 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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GPS1Q13098 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GPS1Q13098 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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GPS1Q13098 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GPS1Q13098 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPS1Q13098 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GPS1Q13098 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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