Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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