| FOXF2 | Q12947 | DYNLT3P1-201 | ENST00000378574 | 347 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1083P-201 | ENST00000384022 | 107 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.525-201 | ENST00000384570 | 113 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.563-201 | ENST00000384707 | 108 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SNORA36B-201 | ENST00000410438 | 131 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1064P-201 | ENST00000410626 | 104 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | MIER3-203 | ENST00000381213 | 5198 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.02 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ROCK2-203 | ENST00000401753 | 4017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.02 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MGAT4C-210 | ENST00000620241 | 3194 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Y_RNA.124-201 | ENST00000363339 | 93 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AL139095.1-201 | ENST00000404326 | 391 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | LINC00393-201 | ENST00000443621 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | RNU7-14P-201 | ENST00000459331 | 62 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP76-201 | ENST00000516277 | 87 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | GNG2-205 | ENST00000554736 | 569 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LINC02277-202 | ENST00000556472 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CERS3-AS1-201 | ENST00000560643 | 372 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL031274.2-201 | ENST00000599419 | 203 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC138915.1-201 | ENST00000565427 | 1685 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TANK-201 | ENST00000259075 | 2152 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR133A1HG-202 | ENST00000581072 | 4226 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LUZP4-201 | ENST00000371920 | 1701 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LCOR-205 | ENST00000421806 | 16004 nt | TSL 3 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | THNSL1-201 | ENST00000376356 | 3691 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SCN1A-219 | ENST00000641575 | 12874 nt | APPRIS ALT1 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SPAM1-206 | ENST00000460182 | 2154 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNF219-AS1-214 | ENST00000607862 | 6001 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU4-82P-201 | ENST00000362443 | 140 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-486P-201 | ENST00000363116 | 107 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP126-201 | ENST00000365092 | 109 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNY3P5-201 | ENST00000384127 | 102 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SNORD14D-201 | ENST00000384390 | 87 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-429P-201 | ENST00000384582 | 108 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR1185-2-201 | ENST00000408687 | 86 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL031386.1-201 | ENST00000411940 | 142 nt | TSL 5 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CYCSP49-201 | ENST00000420810 | 319 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC093423.2-201 | ENST00000429074 | 437 nt | TSL 3 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RPL30P4-201 | ENST00000429309 | 333 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | Z96811.1-201 | ENST00000445880 | 108 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | RPL17P51-201 | ENST00000605218 | 238 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR6129-201 | ENST00000616087 | 109 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | FOXP2-210 | ENST00000403559 | 6415 nt | TSL 2 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CENPCP1-201 | ENST00000533085 | 2578 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | OR2L2-203 | ENST00000642011 | 4225 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZBBX-201 | ENST00000307529 | 3071 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR26A1-201 | ENST00000362205 | 77 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SNORD45.3-201 | ENST00000363836 | 72 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-476P-201 | ENST00000384726 | 107 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR181B1-201 | ENST00000385240 | 110 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AL512604.1-201 | ENST00000404812 | 257 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AL121890.1-201 | ENST00000435457 | 205 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RPL23AP7-203 | ENST00000449021 | 469 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC090515.1-201 | ENST00000465295 | 476 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC010255.2-201 | ENST00000505209 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1337P-201 | ENST00000516525 | 95 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-965P-201 | ENST00000516721 | 96 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC090142.3-201 | ENST00000519012 | 385 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR7515-201 | ENST00000637837 | 67 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SLC6A15-202 | ENST00000309283 | 3108 nt | TSL 5 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ANKRD20A9P-201 | ENST00000457997 | 2978 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AGTR1-204 | ENST00000418473 | 2071 nt | TSL 5 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CACNB4-238 | ENST00000636901 | 7706 nt | TSL 5 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MINDY3-202 | ENST00000378036 | 2452 nt | TSL 2 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | PIK3C2G-203 | ENST00000535651 | 2497 nt | TSL 5 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SNORD114-7-201 | ENST00000362520 | 77 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNA5SP68-201 | ENST00000363885 | 119 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1082P-201 | ENST00000364574 | 107 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SNORA20B-201 | ENST00000384220 | 132 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SNORD116-13-201 | ENST00000384408 | 92 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |