Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
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BPTFQ12830 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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BPTFQ12830 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
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BPTFQ12830 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
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BPTFQ12830 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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BPTFQ12830 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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