Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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