Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CENPFP49454 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.74
CENPFP49454 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CENPFP49454 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CENPFP49454 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CENPFP49454 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CENPFP49454 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
CENPFP49454 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CENPFP49454 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CENPFP49454 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms