Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
PTPRDP23468 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
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