Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms