Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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