Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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