Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TOP1MTQ969P6 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TOP1MTQ969P6 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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