Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UBXN4Q92575 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN4Q92575 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBXN4Q92575 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBXN4Q92575 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBXN4Q92575 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBXN4Q92575 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBXN4Q92575 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBXN4Q92575 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.9 ms