Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KNOP1Q1ED39 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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