Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GEN1Q17RS7 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms