Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPROQ16827 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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