Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN21Q16825 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTPN21Q16825 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPN21Q16825 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN21Q16825 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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