Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CLPPQ16740 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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