Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTF1Q16619 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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