Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC1Q16533 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC1Q16533 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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