Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms