Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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NEDD8Q15843 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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NEDD8Q15843 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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NEDD8Q15843 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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NEDD8Q15843 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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NEDD8Q15843 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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NEDD8Q15843 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NEDD8Q15843 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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NEDD8Q15843 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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NEDD8Q15843 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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NEDD8Q15843 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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NEDD8Q15843 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
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NEDD8Q15843 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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