Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NPTX1Q15818 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms