Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SIX1Q15475 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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