Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3A1Q15459 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SF3A1Q15459 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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