Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
BRD3Q15059 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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