Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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