Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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GBX1Q14549 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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