Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
UBE4AQ14139 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBE4AQ14139 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms