Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PKP1Q13835 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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PKP1Q13835 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PKP1Q13835 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PKP1Q13835 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PKP1Q13835 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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PKP1Q13835 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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