Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDH18Q13634 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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