Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CUL1Q13616 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CUL1Q13616 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CUL1Q13616 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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