Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTMR1Q13613 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTMR1Q13613 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTMR1Q13613 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTMR1Q13613 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MTMR1Q13613 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTMR1Q13613 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTMR1Q13613 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms