Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NAE1Q13564 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms