Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MTM1Q13496 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MTM1Q13496 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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MTM1Q13496 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MTM1Q13496 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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