Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LSAMPQ13449 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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