Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
XRCC4Q13426 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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