Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KLF1Q13351 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KLF1Q13351 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KLF1Q13351 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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