Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2BQ13224 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.4 ms