Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CBX3Q13185 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CBX3Q13185 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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