Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL28Q13084 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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