Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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