Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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