Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms